Les vacances sont déjà entamées et Harry n'a toujours aucune nouvelle provenant du monde des sorciers. La Gazette du Sorcier ne parle pas du retour de Voldemort et les informations moldues ne donnent aucune info sur une éventuelle mort inexpliquée. Voldemort reste discret. Mais tout va changer quand un détraqueur fait irruption à Privet Drive, pour se protéger ainsi que son cousin, Harry devra utiliser le Patronus. Plus tard il reçoit plusieurs lettres lui informant qu'il est convoqué à une audience au ministère pour décider si il sera exclu ou pas de Poudlard. Grâce a l'aide de Lupin, Maugrey et de nouveaux arrivants, comme Tonks, Harry part de Privet Drive direction Square Grimmauld, au QG de l'Ordre du Phénix. Harry y apprendre que l'Ordre a comme but de combattre Voldemort et ses partisans et de réunir le plus de monde dans cette bataille. L'audience arrive, et Harry peut retourner à Poudlard. Il rencontre dans le train, Luna Lovegood, une amie de Ginny légèrement loufoque (d'où son surnom loufoca). Les cours reprennent en l'absence de Hagrid, et d'une nouvelle prof de défense : Ombrage, qui posera quelques problèmes à Harry.
Harry fait de plus en plus de rêves bizarres, dont un qui persiste montrant un couloir avec une porte fermé. Ce qui le poussera a étudier l'Occlumencie un peu plus loin dans le roman.
Malgré tous les décrets établis par la Grande Inquisitrice de Poudlard, (et professeur) Ombrage, Harry crée l'AD : l'Armée de Dumbledore pour approfondir leurs connaissances et défense contre les forces du mal. Plusieurs dizaines de personnes y participent dont Cho Chang.

Le retour d'Hagrid se fait au milieu du livre, il était parti en mission pour les géants, et n'a pas hésiter. à en ramener un, qui s'avère être son demi-frère !

Malgré les cours d'Occlumencie, Harry ne contrôle toujours pas ses rêves et en fait ou il voit Sirius prisonnier prêt à être tuer. Etant persuadé que c'est la vérité il se rend avec Ron, Hermione, Ginny, Neville et Luna au ministère de la Magie pour sauver Sirius. Ceci entraînera la mort d'un des personnages principaux. Je n'en dis pas plus